1-tienes una tabla de registrar donde cada alumno mete sus datos con un unico ID.
2- tienes una tabla de actividades donde cada actividad tiene un unico ID
3- HAces una nueva tabla que relacione IDalumno con IDactividad.
Entonces para saber cuales actividades eligio dado alumno haces una consulta a esta 3a tabla mediante el IDalumno.
Simple no?