Hola, cybersaurio.
En el archivo baners.js que te comentaron antes, pones todo el código, incluido document.write... Luego tu página quedaría algo así:
Código PHP:
<html>
<head>
</head>
<body>
Aqui va parte de la página
<script language="JavaScript" src="baners.js"></script>
Y aquí va el resto
</body>
</html>
Espero que te sirva. Saludos,
P.D. ¿Volveré a chocar con Tunait?