Hola Luisa. Lo que yo haría es,
primero respaldar mi trabajo de 2 semanas, y luego convertir una copia del trabajo a mapa de bits para la salida (cmyk).
Esto aparte de solucionar lo de convertir la malla a cmyk, va a prevenir cualquier tipo de error al exportar para imprimir.
P.D. Sería interesante ver este trabajo tuyo