Gracias David...
Sí, había probado con "DISTINCT", lo que pasa que aquel usuario que puso apellidos de investigación separados por coma, punto o espacio, lo toma como uno diferente y por lo tanto lo repite.
Lo intenté así pero no resulta, igual me repite las cadenas!
Código PHP:
$query = "SELECT
DISTINCT investigacion
FROM usuarios
WHERE
investigacion NOT LIKE '0'
OR investigacion NOT LIKE '% 0,%'
OR investigacion NOT LIKE '0,%'
OR investigacion NOT LIKE '% 0.%'
OR investigacion NOT LIKE '0.%'
OR investigacion NOT LIKE '% 0 %'
OR investigacion NOT LIKE '0 %'
OR investigacion NOT LIKE '% 0'
OR investigacion NOT LIKE '%(0)%'
";