Ya lo he solucionado!!
Para actualizar un combo se haría así:
<select id=”miselect”>
<option>Opcion1</option>
</select>
Para recargarlo haríamos así:
document.getElementById(“miselect”).innerHTML = “<option>Opcion2</option>”;
En Internet Explorer se ha de hacer utilizando un div y en el actualizar todo el combo:
<div id=”miselectDiv”>
<select id=”miselect”>
<option>Opcion1</option>
</select>
</div>
A través de javascript además de inyectarle las option añadimos el propio select (con <select> </select>).
document.getElementById(“miselectDiv“).innerHTML = “<select><option>Opcion2</option></select>”;