Dependiendo del lenguaje y herramientas que utilices serán las opciones. Desde el simple no en todos los lenguajes se usa la misma forma de insertar comentarios.
El que se siga un convenio básicamente es para lograr dos cosas:
1. Generación de documentación (API)
2. Utilización de los comentarios por parte de algún IDE o similar
Herramientas hay varias, tan solo echa un ojo a este enlace:
http://es.wikipedia.org/wiki/Anexo:C...aci%C3%B3n
Solo comentar que creo de lo más "genérico" es Doxygen.