Existen algunas formas de hacerlo, por ejemplo puedes hacer una plantilla especial para IE6, cosa que cuando tu sitio detecte un navegador de ese tipo envíe al usuario a la plantilla especial.
Lo que yo opté con mis sitio y lo recomiendo también para el tuyo es que pongas un código diciendo que tiene un navegador no actualizado y es recomendable actualizarlo o cambiarlo. Yo soy partidario de eso.
Te recomiendo que veas esto:
http://www.maestrosdelweb.com/actual...-adios-al-ie6/ El código que encontrarás lo puedes modificar diciendo igualmente que pueden actualizar o simplemente cambiar por Google Chrome, Firefox, Safari, Opera u otro.
Mucha Suerte!