Hola:
Siempre se ejecutan según el flujo de carga de la página... y si hay 2 variables o funciones del mismo nombre, siempre la segunda "redefine a la anterior"... lamentablemente casi todas las librerías fabrican el método "$()"... y aunque suelen ser básicamente un alias de document.getElementById(), el resto de cosas adicionales, no suelen ser compatibles... tal vez se trate de eso...
Saludos
