Lo primero sería consultar la página oficial en
http://www.gzip.org/ que tiene bastante información sobre esta utilidad. En la versión linux además tiene bastante documentación adjunta y supongo que será igual en la versión para windows.
Te dejo un link que explica una de las varias formas de utilizar la compresión.
http://granimpetu.com/articulos/arch...-mas-pequenos/
De todos modos si tu host corre apache es posible que tenga habilitadas las herramientas necesarias para hacer la compresión directamente en el servidor.