Claro, el problema es el siguiente: el codigo javascript traido con AJAX no es interpretado asi nomas. Hay que "parsearlo"....
Pero para que te vas a meter en eso, si los efectos que vos queres que ese menu tenga se los podes dar con CSS!
Hace el menu que ahora "no anda" completamente en CSS y vas a ver como todo funciona
Si queres para que no te la compliques te dejo este link
http://www.cssmenumaker.com/