Para ese tipo de asuntos funciona un plugin que te sirve para hacer la imposicion de modo que en 1 hoja puedas imprimr 2 paginas Imporser se llama sino me equivoco.
Y para editar un PDF complamente en indesign tiene algo de tiempo ke esixte un plugin de la compañia recosoft que te permite pasar un pdf a indesign.
http://www.recosoft.com/products/pdf2id/index.htm