Podrias hacerlo en crear un while que verifique la base de datos y un if dentro del while que compare alguna variable que este en el while para borre todo registro duplicado, ejemplo
Código PHP:
Ver original$s = "SELECT * FROM tabla";
$var = "";
if($row["ide"].$row["cve"] == $var){
echo $row["ide"]."<br>";
//aqui va la consulta de borrar también con la parte de id, si es que tienes un incrementable
}
$var= $row["ide"].$row["cve"];
}
Analiza el código y verás lo que te digo.