Proba con esto:
Código PHP:
# separo por las comas
$ids = explode( "," , "1,4554,4599,8472,8496,8548,12659,,14066,");
# recorro el nuevo array
foreach( $ids as $id ){
#guardo en otro array los elementos que no esten vacios
if ( !empty( $id ) ) $idsfinales = $id;
}
# Los vuelvo a juntar pero solo los ids
$idfinal = implode( "," , $idsfinales );
# Los remplazo en el sql
$sql_comunidad .= "WHERE a.uid=u.uid AND u.uid IN (".$idfinal.")";
espero que te sirva.