si a mi me ha pasado lo mismo y le he sacado el doctype con otros problema que tube por ejemplo en las tablas y andubo de maravilla y nunc me surgio un problema por haberlo sacado no lo pongas que no pasa nada.
entra aca y fijate que te dice que no es estrictamente necesario.
http://www.elguille.info/htmlscripts/html_doctype.htm