Editar .properties de un JAR firmado

[davidbelika]

Gracias por tu contestación tan detallada. La aplicación se va a ejecutar en una intranet y aparte el cliente quiere que sea con archivo de propiedades.
Donde puedo conseguir algo más de información sobre el 5º punto que me has comentado para ponerlo en funcionamiento.
Que alternativa hay para que los datos de conexión de un .jar no se tengan dentro del propio jar en un .properties