Hola
Julcar, gracias por enlace está interesante.
El detalle es que el problema no tiene que ver con mysql, sino con el sistema operativo. Mysqlhotcopy es como ejecutar:
Código:
mysql lock tables
cp $db /backup/databasebackups/;
mysql unlock tables
Te garantiza una copia integra de la base de datos al bloquear las tablas. El problema está en el copiado de la base de datos que no se porque en unas es rápido y en otras se demora tanto.