Solucionado, por si a alguien le pueder interesar, lo he solucionado con SUM(DISTINCT numeroFactura)
Asi queda el codigo
Código MySQL:
Ver original$sqlTotal="SELECT SUM(DISTINCT totalFactura) AS resultado FROM deporte.factura WHERE proceso='facturado' AND ano=".$_GET['ano']." AND mes='".$_GET['mes']."'";
gracias y hasta otra..... PORQUE SEGURO QUE HABRÁ OTRA