setInterval ejecuta cada x segundos y setTimeout una sola vez después de x segundos, para suspender clearInterval y clearTimeout
Código HTML:
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<title>Prueba</title>
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<script type="text/javascript">
$(function (){
setInterval("mostrar()",1000);
});
var i = 0;
function mostrar (){
$('#cont').append("ejecucion "+ (++i)+"<br />");
}
</script>
</head>
<body>
<div id="cont"></div>
</body>
</html>