Cita:
Iniciado por Rafita-geta 
Y la verdad es que no se como organizarlo para que tenga una buena indexacion y que el bot de google se mueva sin problemas por esas paginas.
La indexación dependerá del contenido y de la relevancia que tenga. Si los enlaces los puede seguir el crawler le hacés fácil las cosas a Google y a cualquier motor de búsqueda.
Finalmente, y de otra manera, no pases por alto la implementación del mapa del sitio (aka sitemap.xml) para que el bot conozca la nueva estructura.
En cuanto a las alternativas, por la modalidad (digo) hacéle las cosas bien fáciles y sencillas al usuario mismo.