Con una rapida busqueda por google he encontrado este articulo:
http://foro.mmus.com.ar/showthread.php?t=81737
aqui comentan como instalar ese software en linux, en ese caso es una ubuntu derivada de Debian mientras que CentOS esta basada en RedHat, por lo que habra algun comando que variada un poco (yum en vez de apt-get), pero basicamente el proceso es el mismo.
No obstante no hace falta que te compliques con la consola, si vas a la web de Wine puedes descargarlo directamente y con un doble clic instalarlo (puedes decargar el binario desde
http://www.winehq.org/download/)
En cuanto a la base de datos, SQL Server no se si puede llegar a correr, pero peudes mirar de instalarlo con uan base de datos MySQL o PosgreSQL