Cita: Tengo scripts en PHP para generar archivos excel, pero por ejemplo si yo ingreso 3 estudios y 2 experiencias laborales, por más que hago inner join y todo me resultan 5 filas como resultado lo que no me conviene, ya que esto servirá para descartar a personas, entonces imaginense, postulan 300 personas al día, por mínimo 5 registros cado uno, son 1500 registros a revisar lo que no es muy idoneo.
Tu problema sería indicativo de que estás haciendo mal la consulta.
Postea la consulta completa y la estructura de las tablas (los CREATE TABLE), para ver cómo mejorar eso.