creo que sigues sin entender bien...
el "conflicto" depende mucho de la configuración de tu
php.ini no es que PHP se haga el mañoso de ves en cuando...
es simple, ¿quieres seguir usando las etiquetas cortas?? ...pues entonces configura tu
php.ini para ello...
maravillosamente puedes usar ambas, siempre y cuando el entorno este configurado así... pero definitivamente, y muchos estarán de acuerdo: ¡es una pésima idea seguir usando etiquetas cortas!!