Código HTML:
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function abrirVentana(pLinea)
{
window.open('Ventana_Seleccionar_ut.php?linea='+pLinea, '', 'width=330,height=252,scrollbars=NO,statusbar=NO,left=500,top=250');
document.getElementById("capaFondo1").style.visibility="visible";
}
<p>Aqui va todo el contenido de la página y más abajo el boton que abre otra ventana
y hace aparecer y desaparecer la capa de fondo.
</p>
<input type="button" name="Buscar" value="Buscar" onClick="abrirVentana(0);">
Eso es lo que tengo en la página...