Mmmm... no se realmente lo que quieres hacer, pero si te estás instalando un servidor en local, te recomiendo XAMPP una aplicación que te instala apache + mysql + php + phpmyadmin + filezilla server + un servidor de email + otros. Es la opción más recomendable para servidores privados y/o en local.
Un Saludo y suerte!!
P.D: Lo de tu archivo, tienes que tenerlo indicado en apache para que redireccione
http://localhost/phpmyadmin a la carpeta donde tengas el phpmyadmin, no solo en el propio phpmyadmin.