Estructura de un sitio.

[Vitesse92]

Hola, buenas tardes a todos y espero todo bien.
Quiero saber opiniones sobre la estructura de mi pagina.

Tengo miles de dudas.
Tengo planeado subir muchas paginas, pero con el mismo servidor al que contrate cuenta.

La cosa es que como ustedes saben la carpeta: /public_html
ahí esta todo lo que se muestra
Pero, esta esta otra carpeta /www
en cual de las dos subo los archivos?
y bueno digamos que sea en la carpeta "/public_html"
Ahí subo mi index, mi carpeta controlador, mi carpeta vista, mi carpeta modelo.. aja? y si luego quiero subir otra pagina web¿? ... con otras carpetas con el mismo nombre :S como le hago¿?...

Acaso al comprar otro dominio, me daran otra carpeta "/public_html" ¿?

Eso hasta ahi... Quiero que repasemos los directorios de mi pagina.
/cache
/Controlador
/imagnes
/vista
/modelo
/media
..index.php
..paginador.php

Esta bien la estructura de mi sitio¿? :S
en la carpeta modelo tengo el archivo que se encarga de realizar las consultas a la base de datos... esta bien esa forma? o hay una mejor? que opinan?