Hola,
Por lo que comentas, parece que supones que ese es el problema. Puede que lo sea, pero a lo mejor el asunto viene por otro lado.
¿Has revisado por un tiempo los procesos del sistema para identificar cuál o cuáles usan más recursos?
Este enlace mencionado por WebTech hace unos días, podría servirte de guía:
http://www.linuxtotal.com.mx/index.p...info_admon_012
¿Has revisado qué hay en esa URL?
Mi mejor sugerencia es que contrates a una empresa para que al menos te haga la valoración del problema y realice un procedimiento inicial de seguridad al servidor, si no quieres o no puedes permitirte pagarlo mensualmente.
No tiene nada de malo si quieres aprender, pero tampoco tiene sentido que lances palos al aire, como por ejemplo el de cambiar el puerto para SSH, cuando nada tiene qué ver con el log de Apache que comentas.
Saludos,