Hola HalconVigia, no se si esto es correcto o si se podria hacer de alguna otra manera, pero esta funcionando.
Código PHP:
$sql = "UPDATE usuarios SET clave='$clave3', clave2='$clave2' WHERE usuario='".$_SESSION['usuario']."'";
mysql_query($sql);
Pienso que es lo mas rudimentario, pero funciona
:D Gracias nuevamente
Un saludo!!!