Estoy viendo el codigo fuente de tu pagina y tenes dos llamadas a dom ready:
Cita: $(document).ready(function() {
Esto puede estar causando problemas. Usa uno solo, y en lo posible en headers.
Tenes claro el uso? Esto hace que lo que haya ahi , en esa seccion , no se ejecute a la primera leida lineal de el html. Recien va a dispararse cuando todas las etiquetas html hayan sido interpretadas (lo cual no implica que los contenidos se muestren ya en pantalla, porque cosas como video, flash y fotos tardan un poquito en cargarse).
Otra cosa. Tenes dos veces incluido el jquery!
Una vez en el header:
Cita: <script type="text/javascript" src="js/jquery.js"></script>
<script type="text/javascript" src="js/s3Slider.js"></script>
Y otra en el body, que me parece mala idea:
Cita: <script type="text/javascript" src="js/jquery.min.js"></script>
<script type="text/javascript" src="js/jquery.hoverIntent.minified.js"></script>
Esto de por si es mala cosa, y lo seria aun mas si las versiones de los jquery fueran diferentes. Muy muy mala cosa.