Podrías leer una líneas del fichero, y si el primer caracter es un punto ".", avanzas a la siguiente línea.
Código c:
Ver originalwhile (!EOF(fichero_entrada)){
fgets(cadena
,255,fichero_entrada
); if(cadena[0] = '.') continue;
else fputs(cadena
,fichero_salida
); }
Salu2!