Help! Settings de PDF para imagenes en monotono

[Porota]

Hola,
Tengo un gran problema.
Me encargaron un anuario que en su mayor parte es a dos colores (verde y negro). Tuve contacto con la imprenta que se va a encargar y me recomendaron lo siguiente: “Si queres hacerlo como duotono, el indesign reconoce tanto Los formatos eps como psd para hacer el PDF. Fijate cuando vayas a hacer el PDF que no tengas seteado el indesign para que te convierta todo a cmyk. Para Las transparencias, el unico formato que el Indesign reconoce es el psd, sino te lo Lee como un parche blanco.”
Hice las imágenes verdes en monotono (no necesito hacerlo en duo, pero probé igual) y las guardé como psd tal cual me lo indicaron. Hasta acá todo bien. Resulta que al hacer el PDF, las imagenes que tienen partes transparentes me salen con un parche blanco. Además no encuentro como evitar que me lo convierta todo a CMYK. Conclusión, qué settings necesito para hacer un PDF a dos colores con transparencias.
De la imprenta no me responden, no sé como solucionarlo y tengo que empezar a armar ya.

Gracias