Hola,
no sé si entendí bien la pregunta pero según lo que entendí...
- en el espacio de trabajo incluís los mc.
- seleccionás todo + click derecho + distribuir a capas (si les pusiste nombre las capas se van a llamar por el nombre del mc)
- en esas capas hacés que el fotograma donde está el mc1 empiece más tarde que el mc2, y éste último más tarde a su vez que el mc3...
no sé si me expliqué bien.. espero que sí!!
saludos