No necesitas iptables ni nada parecido, simplemente levantar los servicios que van a escuchar en esos puertos. Para hacer esto necesitarias saber que servicios tenes instalados/configurados, fijate en /etc/init.d/ que vas a tener una lista de "Init scripts".
Por ejemplo, en caso de utilizar el servidor de mail "postfix" deberias ejecutar:
Si no sabes el estado actual de un servicio puedes hacer
En caso de que los servicios que necesites esten presentes (postfix, sendmail, qmail, etc) pero no se inicien automaticamente cuando arranca el servidor, utiliza el comando 'rc-update' y agregalos. Para mas informacion, revisa la seccion de Init scripts del Gentoo Handbook (el foro no me deja pegarte el link, que mal!).
Personalmente tuve buenas experiencias armando servidores de e-mail en Gentoo utilizando Qmail, Vpopmail, spamassasin, ClamAv y MySQL.
Vamos Gentoo!!!