Y, por cómo has colocado las carpetas ahora, no se verán los botones. Pero sí se ven correctamente si uno respeta la ubicación. Por ejemplo, usando la etiqueta base, este ejemplo funciona como debe e incluso muestra las imágenes (botones) sin inconvenientes:
Código PHP:
<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8" />
<base href="http://www.web.comli.com/" />
<title>Editor Online</title>
<script src="bbcode/bbcode.js"></script>
</head>
<body onload="init('id1')">
<form id="form1" name="form1" method="post" action="">
<textarea id="id1" name="textarea" cols="80" rows="5"></textarea>
</form>
</body>
</html>