Una pregunta porque no llamas a ese javascript directamente de la propiedad
OnClientClick
Supongamos que fuera un botón en el que se muestra el confirm quedaría así
Código xhtml:
Ver original<asp:Button ID="Button1" runat="server" Text="Button" OnClientClick="return confirm('El desea borrar el registro?')"/>
Cuando presiones aceptar se ejecutará el código de lado del servidor, si presionas cancelar... adivina? XD no se hará nada :P
Espero te sirva de algo
