Aunque no lo he probado pero creo que deberia funcionar, usariamos la funcion
shuffle para colocar las tablas que queremos seleccionar de forma aleatoria.
Prueba ensayando esto que hize, a la carrera pero creo que puede servir, colocalo en un archivo .php y mira el resultado.
Código PHP:
$tablas = array('empleados' => ' condicion empleados',
'cargos' => ' condicion cargos',
'prestamos' => ' condicion prestamos');
$claves = array_keys( $tablas );
shuffle( $claves );
$consulta = 'SELECT * FROM ' . $claves[ 0 ] . $tablas[ $claves[ 0 ] ];
echo $consulta;