mira, no se mucho de esto, pero creo que te refieres a que el swf sea transparente. (como que flota)
Para eso tienes que poner:
<param name=wmode value=transparent>
Este es el codigo, que tienes que insertar en el html, donde esta el flash y veas una etiquetas similares.
si quieres que se cierre solo o mediante un boton, tendras que darle un UnLoad Movie, al flash, en donde desees.
espero que te sirva de algo.
Suerte.