Me imagino dos formas
La primera
En el index.php de tu template busca una div con id="header" ... y agregale ese codigo que te dieron te quedaria algo asi
<div id="header">
<!--Tu etiqueta object asi como la pusiste en el post yo le quito la url proque no me deja postear urls-->
<object>
<param name="movie" value="flash/nieve.swf">
<param name="quality" value="high">
<embed src="flash/nieve.swf" quality="high" width="635" height="150"></embed></object>
</div>
cada vez que quieras editar tu header repetir los mismos pasos
Repito en el INDEX.PHP de tu template...
La segunda
abri el index.php de tu tempalte, busca la div id="header" y borra lo que contenga y escribi
<?php if($this->countModules('user1')) : ?>
<jdoc:include type="modules" name="user1" style="xhtml" />
<?php endif; ?>
reemplaza todo lo que dice "user1" por alguna posicion disponible y guarda
Abri el archivo templateDetails.xml y busca donde dice <positions> y tiene una lista de posiciones</positions>
agrega a esa lista <position>user1</position> -----> reemplaza user1 por el nombre que le diste en el index.php
Guarda.
usa el mod_flash para cargar tu header... de esta manera podes cambiar tu animacion del header cuantas veces quieras :)
espero te sirva...