haber espero ayudarte algo, primero que nada usa
http://www.intodns.com para verificar la correcta configuracion de tus DNS
1- los nameserver debes regiistrarlos desde el panel de control de tu dominio principal, si es
www.dominioprincipal.com entonces desde el panel de el dominio agregas los prefijos sean ns1 o ns o dns1 o lo q quieras y lo enlazas con una IP, eso lo haces desde el panel de control de el dominio principal que llevaran las DNS, repito, asi mismo para la segunda DNS
2- los demas dominios que apuntes usando esos DNS deberan enlazarse sin problemas al servidor q tiene las IP's q asignast a tus DNS del dominio principal,
bueno es sencillo cuestion de ver q este bien en intodns, y si lo esta tal vez sea cuestion de esperar la total propagacion de tus cambios DNS que toma de 24 a 48 horas,
saludos cordiales