Amigo es simple, solo pone este codigo antes del loop:
Cita: <?php wp_list_categories('exclude=1' ); ?> // el 1 lo puedes reemplazar por el id de la categoria que quieres excluir
Si no sabes cual es el loop te lo dejo aqui
Cita: <?php if (have_posts()) : while (have_posts()) : the_post(); ?>
Esto lo tienes q poner en el index.php si no quieres que aparescan los post de esa categoria en la pagina principal