Bueno amigos,alfinal he conseguido hacerlo!!Lo que hice fue incluir en el path de win el ejecutable indicado.Una vez hecho eso puse este codigo:
Código:
aplicacion.exec("cmd /c start C:\\Temp8Ho.R");
Lo unico que hay que tener cuidado es donde se pone nuestro script ya que si esta una carpeta dentro de otra y asi sucesivamente pues suelo dar fallo,asi que lo deje directamente en C:.
Un saludo.