A ver vamos por partes parece que los link son incorrectos, estas usando algo asi como:
Código HTML:
<a href="/mipagina.php">milink</a>
Y deberias usar algo como:
Código HTML:
<a href="mipagina.php">milink</a>
Olvidate de usar sitios en Dreamweaver y esas cosas, simplemente edita tus archivos los grabas te vas a tu navegador actualizas y punto.
En mis 10 años de experiencia programando nunca he visto ese error, estas segura que no tienes algun otro servidor activo? ASP o algo asi?