Hola
franciscomusico !
Puedo suponer que quieres desarrollar la capa de dominio en JAVA y la capa de presentación en Flex, no ?
Porqué recientemente ando probando algo similar con la ayuda de merapi que es un puente que permite la comunicación entre estas dos tecnologías.
Enlace al proyecto Merapi.
http://www.merapiproject.net
Y aquí viene un tutorial de como utilizarlo:
http://devgirl.wordpress.com/2008/11...-using-merapi/
Espero te sea de utilidad.
Un saludo y suerte ! 