No entendi lo de "georeferenciacion" y las mismas clases de coneccion..
Ahora si la pregunta es Flex se puede conectar o consumir fuentes de datos la respuesta es si.
No importa que Base de datos uses, la base de datos es consultada mediante el lenguaje servidor que usar, por lo que dices java.
Flex <----> Java <-----> DB
Flex por si mismo no puede acceder a ninguna base de datos a menos que uses AIR para aplicaciones de escritorio (SQLite).
Para hacer la conexion desde Flex a con Java, PHP, ASP etc etc puedes usar varias formas
HTTPRemote o RemoteObject usando AMF.
Mas info
http://livedocs.adobe.com/flex/3/htm..._access_4.html