Bueno Nadia, el tema de cómo cobrar una web se hablado muchísimo en el foro, usa el buscador. Te dejo
esta FAQ para que la revises.
Resumiendo:
Hay varias maneras, pero la más popular es fijar un precio por horas y calcular la cantidad de horas que te lleva el trabajo. Tu costo por hora debería incluri tus costos + tus honorarios. Algunos (como yo) elijen inflar o desinflar un poco el presupuesto según el poder adquisitivo del cliente.