Que error te manda, o por q llegaste a la conclusion que es por el certificado.
No vas a encontrar nada en el webconfig, ya que los certificados de seguridad se montan desde el servidor de IIS, y para saber si tiene o no la unica diferencia es que entras con
https://localhost.
Pero si estaria bien saber q error te manda o por q no puedes levantar el sitio