Hola de nuevo
El LOG de HJT aparece limpio de cualquier malware
Por último te recomiendo que utilizes SUPERAntispyware para tratar de resolver el problema del otro disco duro (no tiene nada que ver si es IDE ó SATA)
Inicia Modo Seguro y analiza con SUPERAntispyware, borra lo seleccionado y pega aqui el informe.
Por último reinicia en Modo Normal y escanea con éste antivirus Online (Usa Internet Explorer)
http://www.eset-la.com/online-scanner/
Guarda el informe y lo pegas aquí
Un saludo