¿WTF!?
Quien te dijo eso??
CUando compras una cuenta reseller, ésta viene con un pack de recursos, entre ellos espacio, transferencia, bases de datos mysql, etc.
Nunca podrías tener problemas con las bases de datos, excepto que el servidor se sature por irresponsabilidad del sysadmin y ahí si el mysql reviente. Pero si estás en una empresa seria no tiene porqué pasar eso. Todo es cuestion de probar.
Saludos