Sigo teniendo problema con Url Amigas

[mark_ant0n]

Sigo teniendo problemas con Url Amigas, lo que pasas es que estoy manejando mi pagina completamente modularizada, y abre dentro dentro de la raiz de mi sitio inde.php. aqui esta mi index.php
Cuando mando a llamar unmodulo lo hago de esta manera

Código url:

http://onlinecomitan.com.mx/?mod=mod_art&opcion=default
 

y para mostrar un articulo lo hago asi

Código url:

http://onlinecomitan.com.mx/?mod=mod_art&opcion=mostrar&item=17
 

Y e intentado de varias maneras, espero que me puedan ayudar, gracias
Este es mi index.php, que se encuentra en la raiz, desde aqui se habren los modulos

Código PHP:

  <?php
error_reporting(E_ALL);
global $path_layout;
include('includes/constructor.php');
require_once("principal.php");
define('inicializacion',1);
if (!empty($_GET['mod'])){
    $modulo = $_GET['mod'];
}else
    $modulo = MODULO_DEFECTO;

if (empty($conf[$modulo]))
        $modulo = MODULO_DEFECTO;

$path_layout = LAYOUT_PATH.'/'."cuerpo.php";
$path_modulo = MODULO_PATH.'/'.$conf[$modulo]['archivo'];
if (file_exists($path_layout)and($modulo=="home")){
    abrirtema();
    include("./tema/".$estilo."/cuerpo.php");
    cabeza();
    abrir($dbi,$tema,$sql);
    if (file_exists( $path_modulo )) include($path_modulo);
    else die('Error al cargar el m&oacute;dulo <b>'.$modulo.'</b>. No existe el archivo <b>'.$conf[$modulo]['archivo'].'</b>');
    cerrar();
    pie();

    }
else{
        include($path_modulo);
}
?>