Cita:
Iniciado por edulopez 
Gracias Darkj, de esta forma si redirige pero no de forma oculta o transparente al usuario.
Gracias de todas formas. Salu2.
yo lo pude hacer de la forma que puso Darkj arriba, es decir pongo lo siguiente en el htaccess
principal:
RewriteEngine on
RewriteCond %{HTTP_HOST} ^subdom.midominio.com$ [NC]
RewriteRule ^(.*)$ /subdom/$1 [L,NC]
y para hacerlo de forma transparente, en el .htaccess de la carpeta a la cual estamos redirigiendo pongo:
RewriteCond %{HTTP_HOST} !^subdom\.midominio\.com$ [NC]
RewriteRule ^(.*)$ h ttp://subdom.midominio.com/$1 [QSA,L,R=301]