Puedes enviar tus archivos por medio de un formulario y PHP, creando un campo para archivo adjunto, como:
<input type="file" name="field_1" id="field_1" >
Por supuesto que tu formulario debe ser multipart/form-data para poder enviar archivos
<form name="mi_formulario" action=''enviar.php" method='post' enctype='multipart/form-data'>
En este artículo del blog que tengo para mis pruebas:
http://disweb.6te.net/wp/?p=8
he ido agregando sitios para la creación de formularios en línea, los primeros servicios que indico son para crear e formulario y el archivo que lo procesará del lado de servidor, al final de ese párrafo hay un para que solo hacen el formulario y en el siguiente párrafo es para sitios con servicio de creación y procesamiento de los datos, donde te dan un script para colocar en tu sitio.
Probá para ver qué servicio se ajusta más a tus necesidades y gustos.